Pencapaian Adeeba telah diiktiraf melalui beberapa anugerah kebangsaan dan antarabangsa termasuk Anugerah Sains Tun Mahathir dan Anugerah Merdeka atas peranannya sebagai ahli Pasukan Penyiasat Nipah Universiti Malaya.

Beliau merupakan penerima pertama Anugerah Global Advance Australia dalam kategori Alumni pada 2012 dan pada April 2015 beliau telah dianugerahkan dengan Doktor Undang-undang (honoris causa) daripada Universiti Monash. Beliau juga mempunyai penghormatan tersendiri kerana telah dipaparkan dalam kedua-dua penerbitan The Lancet dan Science masing-masing pada 2013 dan 2014.

Pada tahun 2022, Adeeba disenaraikan dalam senarai '50 Over 50: Asia 2022' oleh majalah Forbes.[3][10][11]